Integrated Genome Browser
| versiyon |
9 |
| platforms | |
| lisans | Open Source |
| kategori | Scientific |
| Daha fazla bilgi
(yayıncı web sitesini ziyaret edin)
|
Yazılım İnceleme
Ana fonksiyonlar
- GenBank ve FASTA gibi çeşitli genom formatlarını destekler
- Animasyonları yakınlaştırma ve kaydırma ile veriyle etkileşimde bulunma
- QuickLoad sitelerinden genomlara erişin ve yükleyin
- Verileri çeşitli grafik formlarına dönüştürün
- Verileri ortak çalışanlarla Dropbox aracılığıyla paylaşın
- Ek işlevsellik için eklentileri yükleyin
Entegre Genom Tarayıcısı (IGB), büyük genomik veri setlerini görüntülemek ve keşfetmek için kullanılan açık kaynaklı bir programdır. Çeşitli veri biçimlerini görüntüleyebilir, verilerinizle etkileşime girebilir, grafikler oluşturabilir, bilgilerinizi görüntü olarak kaydedebilir ve verilerinizi ortak çalışanlarla paylaşabilirsiniz.
IGB, ek açıklamalardan ve hizalı dizilerden verileri görüntülemenizi sağlar. Program FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband ve GenBank gibi çeşitli formatları destekler. Veri alabilir ve veri farklarını vurgulamak için uyuşmayan grafikler ve kapsamı göstermek için derinlik grafikler dahil çeşitli grafik formlarına dönüştürebilirsiniz. Verilerinizle IGB'nin yakınlaştırma ve kaydırma animasyonlarını kullanarak da etkileşimde bulunabilirsiniz.
IGB, görselleştirme amacıyla basit dizinler, sekanslar ve diğer veri dosyalarından oluşan QuickLoad sitelerinden genomlara erişmenizi ve yüklemenizi sağlar. IGB, komut dosyaları kullanarak işlevsellik ve iş akışı otomasyonu eklemek için eklenti desteğiyle gelişmiş işlevsellik sunar. IGB ayrıca, verilerinizi paylaşmak için yüksek kaliteli bir JPEG, PNG veya SVG resmi olarak yayınlamak ya da ortak çalışanlarınıza projenize erişim sağlamak için verileri Dropbox'ta depolamak için de gelişmiş özellikler sunar.
IGB öncelikle üniversite araştırmacıları, biyologlar ve biyoinformatikçiler tarafından kullanılır. Çeşitli genom veri formatlarını açmak, verileri farklı grafikler olarak görselleştirmek ve ortak çalışanlarla veri paylaşmak için gelişmiş araçlar sunar. Maalesef, program sürekli gelişim için verilen hibelere dayanmaktadır, bu da başvuru için desteğin herhangi bir zamanda sona erebileceği anlamına geliyor. Bununla birlikte, Integrated Genome Browser, genom verilerini araştırmak ve analiz etmek isteyen kullanıcılar için hala yetenekli ve özelleştirilebilir bir programdır.
Updated: 29 Haziran 2016
▶ Kullanılan diğer dosya uzantıları Integrated Genome Browser 9
| Desteklenen dosya türleri | |
|---|---|
| .BED | UCSC BED Annotation Track File |
| .GB | GenBank Data File |
| .FASTA | FASTA Sequence File |
| .DAS | DeltaMaster Analysis Session |
| .SGR | SGR Genome Data File |
| .FA | FASTA Formatted Sequence File |
| .USEQ | USeq Genome Data File |
| Ek ilişkili dosya formatları |
|---|